Сделки с индивидуальным предпринимателем, применяющим упрощенку, не относятся к контролируемым, даже если годовой доход по ним превышает 60 млн рублей.

Сделки между взаимозависимыми лицами признаются контролируемыми, если одна из ее сторон освобождена от уплаты налога на прибыль, а сумма доходов по сделкам превышает 60 млн рублей (пп. 4 п. 2, п. 3 ст. 105.14 НК РФ). Это один из критериев контролируемых сделок. 

Налог на прибыль взимается с организаций, а предприниматели его не уплачивают. То есть при применении УСН от его уплаты освобождаются именно организации (п. 2 ст. 346.11 НК РФ, письмо Минфина России от 01.06.2015 № 03-01-18/31603 ). Поэтому даже если величина годового дохода по сделкам с предпринимателем на УСН превысит 60 млн рублей, эти сделки не относятся к контролируемым. Сообщать о них в налоговую не нужно. 

• Критерии контролируемых сделок 2016

Однако сделки с предпринимателями могут быть признаны контролируемыми:

• если предприниматель применяет общий режим, а сумма дохода по сделкам с ним за год превышает 1 млрд рублей (пп. 1 п. 2 ст. 105.14 НК РФ);
• если предприниматель уплачивает ЕСХН или ЕНВД, а сумма дохода - более 100 млн рублей (пп. 3 п. 2, п. 3 ст. 105.14 НК РФ).